Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms