Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UvssaQ9D479 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UvssaQ9D479 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms