Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D454 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D454 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D454 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D454 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms