Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx29Q9D3S3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Snx29Q9D3S3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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