Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx20Q9D2Y5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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