Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pramef12Q9D2F1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms