Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trappc6bQ9D289 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trappc6bQ9D289 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trappc6bQ9D289 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trappc6bQ9D289 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trappc6bQ9D289 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc6bQ9D289 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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