Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Spns3Q9D232 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Spns3Q9D232 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Spns3Q9D232 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Spns3Q9D232 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms