Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms