Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc3Q9D114 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms