Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Mms19Q9D071 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Mms19Q9D071 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Mms19Q9D071 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Mms19Q9D071 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Mms19Q9D071 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Mms19Q9D071 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Mms19Q9D071 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Mms19Q9D071 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Mms19Q9D071 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mms19Q9D071 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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