Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisa9Q9CZN4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms