Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc8Q9CYA6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms