Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl11Q9CXW4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms