Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx47Q9CWX9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx47Q9CWX9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms