Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prkrip1Q9CWV6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prkrip1Q9CWV6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms