Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd12Q9CWU0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tdrd12Q9CWU0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms