Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NubplQ9CWD8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NubplQ9CWD8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms