Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sycp2Q9CUU3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Sycp2Q9CUU3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms