Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms