Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg12Q9CQY1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg12Q9CQY1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms