Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CQC3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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