Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trappc5Q9CQA1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Trappc5Q9CQA1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc5Q9CQA1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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