Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
1700029P11RikQ9CQ68 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms