Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Use1Q9CQ56 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms