Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Commd4Q9CQ02 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Commd4Q9CQ02 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms