Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nsmce3Q9CPR8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms