Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl17Q9CPR4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms