Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nup155Q99P88 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms