Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sf3b1Q99NB9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf3b1Q99NB9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms