Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Ms4a6dQ99N07 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ms4a6dQ99N07 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ms4a6dQ99N07 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ms4a6dQ99N07 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ms4a6dQ99N07 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ms4a6dQ99N07 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms