Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tdrd1Q99MV1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd1Q99MV1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms