Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sh3bp5lQ99LH9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Sh3bp5lQ99LH9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Sh3bp5lQ99LH9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Sh3bp5lQ99LH9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Sh3bp5lQ99LH9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Sh3bp5lQ99LH9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Sh3bp5lQ99LH9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh3bp5lQ99LH9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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