Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RtcbQ99LF4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms