Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Reep3Q99KK1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Reep3Q99KK1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Reep3Q99KK1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Reep3Q99KK1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Reep3Q99KK1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Reep3Q99KK1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Reep3Q99KK1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Reep3Q99KK1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Reep3Q99KK1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Reep3Q99KK1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Reep3Q99KK1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Reep3Q99KK1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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