Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Derl1Q99J56 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms