Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctu1Q99J10 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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