Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CsprsQ99388 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms