Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf3Q922U1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf3Q922U1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms