Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clip1Q922J3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clip1Q922J3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms