Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tubb6Q922F4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tubb6Q922F4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms