Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smarca5Q91ZW3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms