Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atpaf2Q91YY4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atpaf2Q91YY4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms