Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp1bQ91YK2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms