Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms