Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpm2Q91YD4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpm2Q91YD4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms