Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klc3Q91W40 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klc3Q91W40 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms