Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp3Q91W36 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms