Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx9Q91VH2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms