Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mark1Q8VHJ5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms